Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms