Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms