Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKACBP22694 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKACBP22694 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKACBP22694 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKACBP22694 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKACBP22694 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKACBP22694 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms