Protein–RNA interactions for Protein: P22001

KCNA3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA3P22001 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA3P22001 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA3P22001 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms