Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms