Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF4P18085 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF4P18085 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF4P18085 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF4P18085 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF4P18085 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF4P18085 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF4P18085 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF4P18085 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF4P18085 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF4P18085 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF4P18085 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF4P18085 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms