Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB4P16144 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms