Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSPP15924 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSPP15924 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSPP15924 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSPP15924 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSPP15924 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DSPP15924 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSPP15924 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSPP15924 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSPP15924 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSPP15924 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSPP15924 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSPP15924 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms