Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKCSHP14314 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCSHP14314 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms