Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms