Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF35P13682 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms