Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT13P13646 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT13P13646 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT13P13646 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms