Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms