Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODC1P11926 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODC1P11926 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ODC1P11926 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ODC1P11926 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ODC1P11926 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ODC1P11926 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms