Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms