Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC192P0DO97 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms