Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD2P0DJD1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms