Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms