Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLTAP09496 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLTAP09496 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLTAP09496 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLTAP09496 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms