Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NGFRP08138 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NGFRP08138 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NGFRP08138 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NGFRP08138 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NGFRP08138 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms