Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHOP08100 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHOP08100 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOP08100 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOP08100 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOP08100 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOP08100 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOP08100 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOP08100 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOP08100 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOP08100 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOP08100 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOP08100 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOP08100 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOP08100 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOP08100 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOP08100 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOP08100 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms