Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYCNP04198 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYCNP04198 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYCNP04198 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYCNP04198 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYCNP04198 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms