Protein–RNA interactions for Protein: O95405

ZFYVE9, Zinc finger FYVE domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE9O95405 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ZFYVE9O95405 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZFYVE9O95405 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms