Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYPD3O95274 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYPD3O95274 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYPD3O95274 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYPD3O95274 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYPD3O95274 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYPD3O95274 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms