Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD4O95243 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD4O95243 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD4O95243 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD4O95243 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD4O95243 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD4O95243 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD4O95243 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD4O95243 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD4O95243 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD4O95243 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD4O95243 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD4O95243 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD4O95243 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD4O95243 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD4O95243 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD4O95243 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD4O95243 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD4O95243 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD4O95243 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD4O95243 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms