Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOBTB3O94955 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms