Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms