Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LGR5O75473 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR5O75473 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR5O75473 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR5O75473 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR5O75473 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR5O75473 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR5O75473 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR5O75473 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR5O75473 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR5O75473 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR5O75473 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms