Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR2O75167 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms