Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX16O60231 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX16O60231 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX16O60231 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX16O60231 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX16O60231 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX16O60231 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX16O60231 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX16O60231 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX16O60231 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DHX16O60231 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DHX16O60231 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX16O60231 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX16O60231 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX16O60231 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX16O60231 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms