Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms