Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms