Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCP110O43303 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCP110O43303 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCP110O43303 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCP110O43303 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCP110O43303 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCP110O43303 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCP110O43303 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCP110O43303 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCP110O43303 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCP110O43303 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCP110O43303 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCP110O43303 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCP110O43303 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCP110O43303 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCP110O43303 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCP110O43303 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCP110O43303 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCP110O43303 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCP110O43303 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCP110O43303 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCP110O43303 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCP110O43303 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms