Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms