Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSH5O43196 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSH5O43196 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSH5O43196 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSH5O43196 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSH5O43196 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSH5O43196 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSH5O43196 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSH5O43196 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSH5O43196 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSH5O43196 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSH5O43196 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSH5O43196 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MSH5O43196 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MSH5O43196 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MSH5O43196 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSH5O43196 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSH5O43196 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSH5O43196 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSH5O43196 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSH5O43196 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSH5O43196 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSH5O43196 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSH5O43196 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSH5O43196 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSH5O43196 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSH5O43196 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms