Protein–RNA interactions for Protein: O15370

SOX12, Transcription factor SOX-12, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX12O15370 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOX12O15370 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SOX12O15370 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SOX12O15370 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SOX12O15370 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SOX12O15370 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX12O15370 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX12O15370 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX12O15370 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX12O15370 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX12O15370 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX12O15370 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SOX12O15370 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SOX12O15370 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOX12O15370 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOX12O15370 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOX12O15370 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOX12O15370 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOX12O15370 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms