Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms