Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A1O14983 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A1O14983 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A1O14983 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A1O14983 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2A1O14983 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2A1O14983 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms