Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE40O14503 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms