Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXLO00592 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXLO00592 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXLO00592 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXLO00592 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXLO00592 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXLO00592 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXLO00592 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXLO00592 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXLO00592 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXLO00592 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXLO00592 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXLO00592 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXLO00592 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXLO00592 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXLO00592 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXLO00592 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms