Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AGRNO00468 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AGRNO00468 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AGRNO00468 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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