Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L13C9JLJ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L13C9JLJ4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms