Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms