Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms