Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1CA8MV81 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms