Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L5A8MUK1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L5A8MUK1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms