Protein–RNA interactions for Protein: A0AV02

SLC12A8, Solute carrier family 12 member 8, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A8A0AV02 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A8A0AV02 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A8A0AV02 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms