Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ9

TRAV30, T-cell receptor alpha variable 30 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV30A0A087WSZ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAV30A0A087WSZ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms