Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A6Q9Y289 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A6Q9Y289 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A6Q9Y289 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A6Q9Y289 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC5A6Q9Y289 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms