Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MED23Q9ULK4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
MED23Q9ULK4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MED23Q9ULK4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MED23Q9ULK4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MED23Q9ULK4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
MED23Q9ULK4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms